Должен ли покупатель новой автомашины платить ндс

Это как Вы договоритесь с продавцом, но обычно именно на покупателя перекладывается НДС

НДС, как правило, входит в стоимость приобретаемой вещи. По Вашей информации в договоре купли-продажи предусматривался НДС. Дале Вы утверждаете, что "об ндс сказали когда была уплачена стоимость машины". Но Вы же читали договор купли-продажи и подписывали его? Следовательно, сами должны были знать, что стоимость автомобиля включается и НДС. Очевидно, что Вам просто напомнили о необходимости уплаты НДС, что предусматривалось договором.